登録されようとしている動画コンテンツは、インターレースという動画の方式で作成されていはいないでしょうか？
（インターレース参考： http://aviutl.info/innta-re-su-purogurassibu/）
iOSのいくつかの端末はこちらのインターレース形式に対応しておらず、再生ができません。
こちらのインターレース動画をプログレッシブ方式に変換することでiPadでも再生ができるようになりますが、もとの動画の映像内容によりプログレッシブに変換する方法が異なるため、ムービーライブラリの動画変換機能では、そのような変換はしておりません。
（変換により画質が大きく変わる可能性があるため、動画の映像内容に沿った変換が必要になります。）
プログレッシブ形式に変換の上ご登録をお願いいたします。